Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
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Hoxd10P28359 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Hoxd10P28359 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxd10P28359 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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