Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpbP27790 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpbP27790 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpbP27790 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpbP27790 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpbP27790 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpbP27790 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpbP27790 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpbP27790 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpbP27790 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CenpbP27790 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CenpbP27790 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CenpbP27790 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
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