Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6aP27664 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms