Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cdk11bP24788 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk11bP24788 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms