Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZfaP23607 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZfaP23607 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ZfaP23607 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZfaP23607 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZfaP23607 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZfaP23607 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZfaP23607 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms