Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja1P23242 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja1P23242 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja1P23242 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja1P23242 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja1P23242 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja1P23242 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja1P23242 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms