Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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