Protein–RNA interactions for Protein: P16882

Ghr, Growth hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GhrP16882 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GhrP16882 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GhrP16882 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GhrP16882 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GhrP16882 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GhrP16882 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GhrP16882 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GhrP16882 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GhrP16882 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GhrP16882 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GhrP16882 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GhrP16882 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GhrP16882 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GhrP16882 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GhrP16882 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GhrP16882 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GhrP16882 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GhrP16882 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GhrP16882 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GhrP16882 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GhrP16882 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GhrP16882 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GhrP16882 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GhrP16882 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GhrP16882 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GhrP16882 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GhrP16882 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GhrP16882 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GhrP16882 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GhrP16882 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GhrP16882 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GhrP16882 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GhrP16882 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GhrP16882 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GhrP16882 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GhrP16882 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GhrP16882 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GhrP16882 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GhrP16882 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GhrP16882 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GhrP16882 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GhrP16882 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GhrP16882 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GhrP16882 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GhrP16882 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GhrP16882 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GhrP16882 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GhrP16882 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GhrP16882 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GhrP16882 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GhrP16882 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GhrP16882 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GhrP16882 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GhrP16882 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GhrP16882 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GhrP16882 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GhrP16882 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GhrP16882 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GhrP16882 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GhrP16882 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GhrP16882 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GhrP16882 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GhrP16882 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GhrP16882 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GhrP16882 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GhrP16882 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GhrP16882 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GhrP16882 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GhrP16882 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GhrP16882 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GhrP16882 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms