Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME1P15531 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME1P15531 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME1P15531 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME1P15531 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NME1P15531 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME1P15531 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME1P15531 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME1P15531 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME1P15531 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME1P15531 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME1P15531 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME1P15531 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME1P15531 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME1P15531 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME1P15531 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NME1P15531 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME1P15531 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME1P15531 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME1P15531 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME1P15531 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME1P15531 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME1P15531 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NME1P15531 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME1P15531 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME1P15531 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME1P15531 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NME1P15531 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NME1P15531 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NME1P15531 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME1P15531 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME1P15531 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME1P15531 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME1P15531 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME1P15531 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME1P15531 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME1P15531 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME1P15531 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME1P15531 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME1P15531 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NME1P15531 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME1P15531 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME1P15531 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME1P15531 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME1P15531 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME1P15531 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME1P15531 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME1P15531 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME1P15531 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NME1P15531 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME1P15531 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME1P15531 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME1P15531 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME1P15531 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME1P15531 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms