Protein–RNA interactions for Protein: P15388

Kcnc1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc1P15388 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms