Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Defa1P11477 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms