Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Amd1P0DMN7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms