Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Becn2P0DM65 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Becn2P0DM65 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms