Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itgb1P09055 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb1P09055 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms