Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc8P09025 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms