Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NefmP08553 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NefmP08553 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NefmP08553 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NefmP08553 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NefmP08553 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NefmP08553 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NefmP08553 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NefmP08553 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NefmP08553 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NefmP08553 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NefmP08553 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NefmP08553 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NefmP08553 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NefmP08553 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NefmP08553 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NefmP08553 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NefmP08553 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NefmP08553 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NefmP08553 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NefmP08553 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NefmP08553 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NefmP08553 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NefmP08553 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NefmP08553 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NefmP08553 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NefmP08553 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NefmP08553 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NefmP08553 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NefmP08553 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NefmP08553 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NefmP08553 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NefmP08553 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NefmP08553 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NefmP08553 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NefmP08553 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NefmP08553 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NefmP08553 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NefmP08553 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NefmP08553 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NefmP08553 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NefmP08553 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NefmP08553 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NefmP08553 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NefmP08553 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NefmP08553 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NefmP08553 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NefmP08553 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NefmP08553 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NefmP08553 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NefmP08553 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NefmP08553 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NefmP08553 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NefmP08553 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NefmP08553 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefmP08553 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefmP08553 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefmP08553 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefmP08553 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefmP08553 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefmP08553 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NefmP08553 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefmP08553 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefmP08553 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefmP08553 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefmP08553 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefmP08553 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefmP08553 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefmP08553 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefmP08553 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefmP08553 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NefmP08553 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NefmP08553 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NefmP08553 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NefmP08553 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NefmP08553 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NefmP08553 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NefmP08553 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NefmP08553 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NefmP08553 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NefmP08553 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NefmP08553 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NefmP08553 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NefmP08553 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NefmP08553 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NefmP08553 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NefmP08553 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NefmP08553 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NefmP08553 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NefmP08553 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NefmP08553 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NefmP08553 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NefmP08553 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NefmP08553 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NefmP08553 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NefmP08553 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NefmP08553 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NefmP08553 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NefmP08553 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NefmP08553 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms