Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp1P08042 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp1P08042 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp1P08042 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp1P08042 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp1P08042 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp1P08042 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp1P08042 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp1P08042 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp1P08042 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp1P08042 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms