Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtrP07309 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TtrP07309 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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TtrP07309 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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TtrP07309 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TtrP07309 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TtrP07309 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms