Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl20O89093 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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