Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnt1O88346 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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