Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PrxO55103 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrxO55103 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrxO55103 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrxO55103 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrxO55103 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrxO55103 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrxO55103 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrxO55103 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrxO55103 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrxO55103 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrxO55103 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrxO55103 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrxO55103 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrxO55103 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrxO55103 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrxO55103 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrxO55103 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrxO55103 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrxO55103 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrxO55103 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrxO55103 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrxO55103 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrxO55103 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrxO55103 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrxO55103 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrxO55103 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrxO55103 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrxO55103 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrxO55103 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrxO55103 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrxO55103 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrxO55103 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrxO55103 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PrxO55103 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrxO55103 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrxO55103 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrxO55103 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrxO55103 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrxO55103 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrxO55103 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrxO55103 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrxO55103 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrxO55103 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrxO55103 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrxO55103 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrxO55103 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrxO55103 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrxO55103 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrxO55103 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrxO55103 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrxO55103 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrxO55103 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrxO55103 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrxO55103 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrxO55103 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrxO55103 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrxO55103 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrxO55103 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrxO55103 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrxO55103 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PrxO55103 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PrxO55103 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrxO55103 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrxO55103 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrxO55103 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrxO55103 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrxO55103 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrxO55103 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrxO55103 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrxO55103 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrxO55103 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrxO55103 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrxO55103 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrxO55103 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrxO55103 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrxO55103 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrxO55103 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrxO55103 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PrxO55103 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrxO55103 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrxO55103 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrxO55103 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrxO55103 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrxO55103 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrxO55103 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrxO55103 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrxO55103 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrxO55103 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrxO55103 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrxO55103 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrxO55103 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PrxO55103 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PrxO55103 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrxO55103 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrxO55103 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrxO55103 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrxO55103 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrxO55103 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PrxO55103 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms