Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffbO54788 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffbO54788 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffbO54788 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffbO54788 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffbO54788 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffbO54788 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffbO54788 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffbO54788 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffbO54788 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffbO54788 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffbO54788 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffbO54788 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffbO54788 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffbO54788 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffbO54788 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffbO54788 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffbO54788 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffbO54788 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffbO54788 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffbO54788 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffbO54788 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffbO54788 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffbO54788 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffbO54788 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffbO54788 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffbO54788 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffbO54788 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffbO54788 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffbO54788 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffbO54788 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffbO54788 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffbO54788 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffbO54788 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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