Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EdaO54693 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EdaO54693 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EdaO54693 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EdaO54693 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EdaO54693 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EdaO54693 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EdaO54693 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EdaO54693 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EdaO54693 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EdaO54693 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EdaO54693 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EdaO54693 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EdaO54693 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EdaO54693 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EdaO54693 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EdaO54693 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EdaO54693 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EdaO54693 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EdaO54693 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EdaO54693 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EdaO54693 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EdaO54693 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EdaO54693 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EdaO54693 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EdaO54693 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EdaO54693 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EdaO54693 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EdaO54693 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EdaO54693 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EdaO54693 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EdaO54693 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EdaO54693 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EdaO54693 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EdaO54693 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EdaO54693 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EdaO54693 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EdaO54693 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EdaO54693 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EdaO54693 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EdaO54693 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EdaO54693 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EdaO54693 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EdaO54693 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EdaO54693 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EdaO54693 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EdaO54693 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EdaO54693 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EdaO54693 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EdaO54693 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EdaO54693 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EdaO54693 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EdaO54693 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EdaO54693 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EdaO54693 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EdaO54693 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EdaO54693 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EdaO54693 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EdaO54693 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EdaO54693 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EdaO54693 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EdaO54693 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EdaO54693 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EdaO54693 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EdaO54693 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EdaO54693 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EdaO54693 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EdaO54693 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EdaO54693 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EdaO54693 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EdaO54693 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EdaO54693 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EdaO54693 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EdaO54693 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EdaO54693 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EdaO54693 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EdaO54693 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EdaO54693 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EdaO54693 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EdaO54693 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EdaO54693 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EdaO54693 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EdaO54693 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EdaO54693 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EdaO54693 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EdaO54693 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EdaO54693 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EdaO54693 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EdaO54693 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EdaO54693 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EdaO54693 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EdaO54693 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EdaO54693 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EdaO54693 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EdaO54693 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EdaO54693 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EdaO54693 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EdaO54693 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EdaO54693 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EdaO54693 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms