Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bnc1O35914 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bnc1O35914 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms