Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Opn1mwO35599 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Opn1mwO35599 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn1mwO35599 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms