Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Slc18a3O35304 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc18a3O35304 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms