Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Ptpn9O35239 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Ptpn9O35239 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Ptpn9O35239 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Ptpn9O35239 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Ptpn9O35239 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Ptpn9O35239 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptpn9O35239 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Ptpn9O35239 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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