Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnk3O35111 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Kcnk3O35111 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Kcnk3O35111 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Kcnk3O35111 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms