Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cldn4O35054 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn4O35054 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms