Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Degs1O09005 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Degs1O09005 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Degs1O09005 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Degs1O09005 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Degs1O09005 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Degs1O09005 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Degs1O09005 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Degs1O09005 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Degs1O09005 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Degs1O09005 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Degs1O09005 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Degs1O09005 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Degs1O09005 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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