Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ncoa3O09000 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncoa3O09000 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms