Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcshO08795 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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