Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AlyrefO08583 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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