Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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BC117090L7N257 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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BC117090L7N257 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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BC117090L7N257 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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BC117090L7N257 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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BC117090L7N257 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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BC117090L7N257 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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BC117090L7N257 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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BC117090L7N257 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC117090L7N257 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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BC117090L7N257 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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BC117090L7N257 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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BC117090L7N257 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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BC117090L7N257 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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BC117090L7N257 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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BC117090L7N257 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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