Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccer2J3QPU5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer2J3QPU5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms