Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm5849J3QPE5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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