Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gm21797J3QNW5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm21797J3QNW5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm21797J3QNW5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm21797J3QNW5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm21797J3QNW5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm21797J3QNW5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm21797J3QNW5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm21797J3QNW5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm21797J3QNW5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21797J3QNW5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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