Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Gm3336J3QMQ6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gm3336J3QMQ6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gm3336J3QMQ6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gm3336J3QMQ6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gm3336J3QMQ6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gm3336J3QMQ6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Gm3336J3QMQ6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Gm3336J3QMQ6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3336J3QMQ6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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