Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcdh9F8VPK8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms