Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SmgcF6VRN1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SmgcF6VRN1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms