Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28305F6U473 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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