Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21977F6U3N7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms