Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lmod3E9QA62 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmod3E9QA62 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms