Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051665E9Q623 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms