Protein–RNA interactions for Protein: E9Q501

Gm2237, Predicted gene 2237, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2237E9Q501 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2237E9Q501 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2237E9Q501 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms