Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20425E9Q035 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20425E9Q035 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms