Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms