Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3U4

9630041A04Rik, RIKEN cDNA 9630041A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9630041A04RikD3Z3U4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
9630041A04RikD3Z3U4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms