Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SafbD3YXK2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SafbD3YXK2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms