Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gm3259D3YUK0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gm3259D3YUK0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Gm3259D3YUK0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3259D3YUK0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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